Автор: Росен Илиев
Палиндромът е последователност от букви и / или думи, които се четат по един и същи начин отпред и отзад.
Палиндромите също така се срещат и в ДНК.
Съществуват два вида:
1. Палиндроми, които се случват в противоположно направление на един и същи участък на ДНК спиралата.
5′ GGCC 3′
3′ CCGG 5′
Този тип палиндром служи като цел за най-голяма рестрикция на ензимите.
Графиката показва палиндромни последователности „видени“ от пет ограничени ензима (в синьо), които обикновено се използват при работата на рекомбинантната ДНК.
2. Обърнати повторения
В тези случаи, два различни сегмента на двойната спирала се четат по един и същи начин, но в противоположна посока.
5′ AGAACAnnnTGTTCT 3′
3′ TCTTGTnnnACAAGA 5′
Обърнати повторения често се срещат при:
– ДНК, която се свързва с транскрипционни фактори.
– ДНК последователност, показана по-горе, като елемент на отговор на всеки глюкокортикостероид, където N представлява всеки нуклеотид.
Графиката показва „разпозната спирала“, при която САР протеина (хомодимер) се свързва в lac operon на бактерията ешерихия коли.
ДНК-то на много транспозони е оградено от обърнати повторения като тези:
5′ GGCCAGTCACAATGG..~400 nt..CCATTGTGACTGGCC 3′
3′ CCGGTCAGTGTTACC..~400 nt..GGTAACACTGACCGG 5′
Обърнатите повторения в двата края на антиретровирусните генни последователности помагат за въвеждането на ДНК копие в ДНК-то на гостоприемника.
Човешката Y- хромозома съдържа 7 набора от гени – всеки комплект, съдържащ 2-6 почти еднакви гена – ориентирани гръб към гръб или глава към глава, тоест, те са обърнати повторения като частта показана тук. (тиретата представляват хиляди базови двойки, които отделят съседни палиндроми).
5′ …CACAATTCCCATGGGTTGTGGGAG 3′ –––– 5′ CTCCCACAACCCATGGGATTTGTG… 3′
3′ …GTGTTAAGGGTACCCAACACCCTC 5′ –––– 3′ GAGGGTGTTGGGTACCCTAAACAC… 5′
